Sur Coupe-Gorge, île mal famée de l'archipel dans les nuages, Rémy découvre Orage, un bébé dragon sauvage, et le subtilise au nez et à la barbe d'un pirate du ciel. Sur l'île capitale, la princesse Gem apprend que la magie s'amenuise, menaçant le royaume de destruction. Pour le sauver, elle doit obtenir l'aide des dragons disparus, une mission à haut risque qui la mène droit vers Rémy.